مکانیسم های مولکولی بیماریزایی میکروبی: در طول چهار دهه گذشته مطالعات مولکولی بیماریزایی میکرو ارگانیسم ها منجر به یک انفجار اطلاعاتی در مورد مولکول های گوناگون میزبان و میکروب که فرآیند عفونت و بیماری را بوجود می آورند شده است . این فرآیندها را میتوان به چندین مرحله تقسیم کرد : برخورد با میکروب ورود آن به میزبان ، رشد میکروب پس از ورود ، اجتناب از دفاعی ذاتی میزبان تهاجم بافتی و ترو پیسم ، آسیب بافتی ، و انتقال به میزبان های جدید . ویرو لانس عبارتست از میزان ظرفیت یک ارگانیسم برای ایجاد بیماری و نتیجه عوامل بیمار یزایی است که توسط میکروبها اعمال میگردد.این عوامل موجب کلونیزاسیون (حضور ساده ارگانیسم هایی که بالقوه پاتوژن هستند درون یا روی بدن میزبان ) عفونت اتصال و رشد پاتوژن ها و اجتناب از دفاع میزبان )و بیماریها (اغلب ، ولی نه همیشه ، نتیجه فعالیت های توکسین های مترش
عوامل موثر در عفونت: برای وقوع هر نوع فرآیند عفونی ابتدا باید عامل پاتوژن و میزبان با یکدیگر رو برو شوند .بنابراین عواملی نظیر موقعیت جغرافیائ، محیط ، آب وهوا رفتار میتوانند بر احتمال وقوع عفونت تأثیر بگذارند . علیرغم برخورد آنکه اولیه بین یک میزبان مستعد و یک ارگانیسم ها میتوانند سالها قبل از ایجاد علائم بالینی در بدن میزبان پناه گیرند برای دستیابی به یک دید کامل هر بیمار باید به توجه به بافت جمعیتی که به آن تعلق دارد در نظر گرفته شود . بیماریهای عفونی اغلب بصورت ایزوله ایجاد نمیشوند ، بلکه در بین عده ای که بایک منبع آلوده در تماس بوده اند پخش میشوند (مثلا یک منبع آب آلوده) و یا از یک فرد به فرد دیگر منتقل میشوند (مثلا از راه قطرات موجود در هوای تنفسی )بنابراین پزشک باید نسبت به شیوع عفونت ها در کل یک جامعه آگاهی داشته باشد یک شرح حال دقیق شامل اطلاعات در مورد مسافرت ، عو